空气中的微生物大多依附在尘埃粒子上，形成生物活性粒子，洁净室检测中的浮游菌测试，就是通过采用浮游菌采样仪，收集一定数量的空气，一般是100L/min，空气中的活性粒子以10.8m/s的速度撞击到培养皿上，被事先安装好的培养基平皿捕获，达到采样的目的。每个测试点一般测试一次。
浮游菌采样参照尘埃粒子测试点数取样，在工作台面上均匀分布。浮游菌采样量，参见国标GB/T16396-2010工业洁净室（区）浮游菌的测试方法小采样量为A级1000L、B 500L、C 100L、D100L,试验时取对照皿做阴性对照，对照皿与采样皿同法操作，但不需要暴露采样。
放置采样后的平皿于培养箱中，在温度30-35℃的培养箱内培养48～72小时。培养结束后，用肉眼对培养皿上所有的菌落直接计数、标记，然后用5—10倍放大镜检查有无遗漏。通过计算培养基上微生物的量判断空气中浮游菌的数量，证明洁净室检测验证结果，浮游菌符合相应洁净度的要求。
