使用制冷恒温器离不开其规范的使用操作，制冷恒温器在销售时会配套相应的使用说明书，用户在使用时可事先了解下。
制冷恒温器能为用户提供热冷却受控、恒温均匀的场源，也可作为直接加热、制冷、辅助加热、辅助制冷的热源或冷源，全量程范围内的温度控制，应用于石化、制药等化学反应过程控制，在反应釜、全自动合成仪器、萃取和冷凝装置中的恒温控温或外循环应用。
制冷恒温器以制冷机作为介质，将其他需要冷却的仪器或设备产生的热量输送出去，通过制冷系统将热量送到设备外部，确保设备在正常温度范围内工作。该装置和仪表之间依靠装置内泵的压力形成闭式介质循环，通过温度传感器检测介质温度，实现冷却器的控制。
制冷恒温器应安装在环境良好的实验室内，且在通风良好、无尘的稳固地面或实验台面上，避免飞沫、多蒸气及可能发生流入、流滞、泄漏气体的地方，避免靠近可产生高频设备的地方(高频电焊机等)。
制冷恒温器在避免频繁使用酸性溶液和频繁使用特殊喷雾器(含硫化物等)的情况下，从维护和安装时的方便和方面考虑，应尽量确保在室内机和障碍物之间有足够的空间。
只要在日常使用制冷恒温器的时候，按照厂家的操作说明书规范操作并定期保养就可以。